Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col1a2Q01149 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col1a2Q01149 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms