Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csf2raQ00941 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csf2raQ00941 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csf2raQ00941 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms