Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SeleQ00690 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SeleQ00690 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SeleQ00690 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms