Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pax8Q00288 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pax8Q00288 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax8Q00288 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms