Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cited1P97769 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cited1P97769 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms