Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkx3-1P97436 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nkx3-1P97436 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx3-1P97436 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx3-1P97436 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nkx3-1P97436 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms