Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nbr1P97432 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nbr1P97432 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nbr1P97432 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms