Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lig3P97386 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lig3P97386 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lig3P97386 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lig3P97386 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lig3P97386 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms