Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Frg1P97376 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Frg1P97376 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Frg1P97376 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms