Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sec1P97353 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec1P97353 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sec1P97353 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec1P97353 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec1P97353 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec1P97353 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec1P97353 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec1P97353 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms