Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cbx1P83917 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cbx1P83917 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cbx1P83917 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
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