Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx2P80206 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx2P80206 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms