Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Otx1P80205 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Otx1P80205 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otx1P80205 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms