Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad50P70388 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad50P70388 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad50P70388 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad50P70388 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad50P70388 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad50P70388 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad50P70388 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad50P70388 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms