Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54lP70270 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54lP70270 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54lP70270 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms