Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NfixP70257 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NfixP70257 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfixP70257 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NfixP70257 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NfixP70257 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfixP70257 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfixP70257 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NfixP70257 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NfixP70257 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfixP70257 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfixP70257 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NfixP70257 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NfixP70257 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NfixP70257 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfixP70257 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfixP70257 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfixP70257 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfixP70257 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfixP70257 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfixP70257 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfixP70257 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfixP70257 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NfixP70257 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfixP70257 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NfixP70257 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfixP70257 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfixP70257 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NfixP70257 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfixP70257 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfixP70257 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NfixP70257 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfixP70257 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfixP70257 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230 ms