Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plxna3P70208 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Plxna3P70208 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plxna3P70208 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plxna3P70208 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Plxna3P70208 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Plxna3P70208 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Plxna3P70208 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Plxna3P70208 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms