Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PrkcbP68404 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PrkcbP68404 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PrkcbP68404 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms