Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp3caP63328 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp3caP63328 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp3caP63328 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms