Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra1P62812 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gabra1P62812 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms