Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vsnl1P62761 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vsnl1P62761 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsnl1P62761 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms