Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Copz1P61924 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Copz1P61924 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms