Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vbp1P61759 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vbp1P61759 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms