Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Siah1aP61092 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Siah1aP61092 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms