Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab5bP61021 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab5bP61021 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab5bP61021 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms