Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrn4P59383 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrn4P59383 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrn4P59383 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms