Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scarf2P59222 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scarf2P59222 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scarf2P59222 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms