Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Paxbp1P58501 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Paxbp1P58501 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Paxbp1P58501 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms