Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Setd4P58467 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Setd4P58467 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Setd4P58467 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms