Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtdsplP58465 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtdsplP58465 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtdsplP58465 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms