Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Strn4P58404 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Strn4P58404 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strn4P58404 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Strn4P58404 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Strn4P58404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms