Protein–RNA interactions for Protein: P58390

Kcnn2, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn2P58390 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kcnn2P58390 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kcnn2P58390 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn2P58390 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn2P58390 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn2P58390 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms