Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cyp2c40P56657 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cyp2c40P56657 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cyp2c40P56657 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms