Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GferP56213 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GferP56213 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GferP56213 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GferP56213 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GferP56213 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GferP56213 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GferP56213 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GferP56213 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GferP56213 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GferP56213 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GferP56213 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GferP56213 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GferP56213 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GferP56213 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GferP56213 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GferP56213 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GferP56213 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GferP56213 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GferP56213 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GferP56213 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GferP56213 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms