Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GalcP54818 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GalcP54818 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GalcP54818 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GalcP54818 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GalcP54818 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GalcP54818 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GalcP54818 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GalcP54818 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GalcP54818 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GalcP54818 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GalcP54818 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GalcP54818 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GalcP54818 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GalcP54818 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GalcP54818 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GalcP54818 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GalcP54818 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GalcP54818 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GalcP54818 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GalcP54818 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GalcP54818 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GalcP54818 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GalcP54818 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GalcP54818 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GalcP54818 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GalcP54818 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GalcP54818 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GalcP54818 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GalcP54818 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GalcP54818 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GalcP54818 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GalcP54818 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GalcP54818 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GalcP54818 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GalcP54818 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GalcP54818 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GalcP54818 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GalcP54818 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GalcP54818 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GalcP54818 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GalcP54818 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GalcP54818 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GalcP54818 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GalcP54818 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms