Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nub1P54729 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nub1P54729 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nub1P54729 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nub1P54729 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms