Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad23aP54726 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad23aP54726 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad23aP54726 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms