Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacnb3P54285 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb3P54285 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb3P54285 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms