Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CebpaP53566 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CebpaP53566 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CebpaP53566 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CebpaP53566 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms