Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClgnP52194 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClgnP52194 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ClgnP52194 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClgnP52194 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms