Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpbP50405 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpbP50405 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpbP50405 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms