Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SftpdP50404 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpdP50404 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SftpdP50404 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms