Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Srp9P49962 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp9P49962 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp9P49962 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Srp9P49962 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp9P49962 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms