Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcls1P49710 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcls1P49710 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Hcls1P49710 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hcls1P49710 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcls1P49710 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.5 ms