Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CitP49025 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CitP49025 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CitP49025 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CitP49025 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CitP49025 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CitP49025 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CitP49025 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CitP49025 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CitP49025 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CitP49025 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CitP49025 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CitP49025 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CitP49025 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CitP49025 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CitP49025 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CitP49025 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CitP49025 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms