Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gbx2P48031 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms