Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sdc2P43407 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sdc2P43407 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms