Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc1a2P43006 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc1a2P43006 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc1a2P43006 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms