Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LifrP42703 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LifrP42703 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LifrP42703 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LifrP42703 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LifrP42703 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LifrP42703 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LifrP42703 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LifrP42703 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LifrP42703 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LifrP42703 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LifrP42703 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LifrP42703 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LifrP42703 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LifrP42703 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LifrP42703 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LifrP42703 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LifrP42703 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LifrP42703 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LifrP42703 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LifrP42703 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LifrP42703 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LifrP42703 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LifrP42703 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LifrP42703 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LifrP42703 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LifrP42703 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LifrP42703 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LifrP42703 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LifrP42703 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LifrP42703 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LifrP42703 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LifrP42703 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LifrP42703 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms