Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Timp3P39876 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Timp3P39876 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms